可以。该酒店的“孔乙己”立体商标已经取得实际注册。
根据《商标法》第8条的规定：任何能够将自然人、法人或者其他组织的商品与他人的商品区别开的可视性标志，包括文字、图形、字母、数字、三维标志和颜色组合，以及上述要素的组合，均可以作为商标申请注册。因此，该酒店可以以“孔乙己”立体商标向商标局申请注册，即可以申请注册三维标志为商标。关于三维标志的规定是修正后的《商标法》新增加的内容，也就是说，根据修正后的《商标法》，我国商标法所规定的商标类型从原有的平面商标扩大到立体商标。对于某些力图在本行业中标新立异的企业、个人来说，不妨考虑注册新颖、独特的三维标志商标作为自己的标志。

[法律依据] 《商标法》第8条。